Paquet : vt (0.57721+ds-3)

[ Paquet source : vt  ]

ensemble d’outils pour la recherche de variants courts dans des données de séquence génétique

vt est un ensemble d’outils pour variants qui recherche les variants courts à partir de données de séquençage de nouvelle génération.

Vt-normalize est un outil pour normaliser la représentation de variants génétiques dans le fichier VCF (Variant Call Format). Cette normalisation est définie formellement sous forme de représentation cohérente de variants génétiques de manière concise et non ambigüe. Dans vt, un algorithme simple et général est mis en œuvre pour la faire appliquer.

Autres paquets associés à vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nouvelle bibliothèque d'expressions rationnelles compatibles Perl –⋅fichiers d'exécution⋅8⋅bits

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	756,2 ko	2 565,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	624,3 ko	2 241,0 ko	[liste des fichiers]
armel	604,2 ko	2 152,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	624,4 ko	1 524,0 ko	[liste des fichiers]
i386	763,0 ko	2 776,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	576,1 ko	3 225,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	580,6 ko	2 977,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	693,5 ko	2 833,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	638,5 ko	2 533,0 ko	[liste des fichiers]