Paquet : vt (0.57721+ds-3)

[ Paquet source : vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Autres paquets associés à vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nouvelle bibliothèque d'expressions rationnelles compatibles Perl –⋅fichiers d'exécution⋅8⋅bits

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	756,2 ko	2 565,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	624,3 ko	2 241,0 ko	[liste des fichiers]
armel	604,2 ko	2 152,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	624,4 ko	1 524,0 ko	[liste des fichiers]
i386	763,0 ko	2 776,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	576,1 ko	3 225,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	580,6 ko	2 977,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	693,5 ko	2 833,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	638,5 ko	2 533,0 ko	[liste des fichiers]