Package: vt (0.57721+ds-3)

[ Source: vt  ]

Værktøjssæt for kort variant-registrering i genetiske sekvensdata

Vt er et variantværktøjssæt til at normalisere korte varianter fra Next Generation Sequencing-data.

Vt-normalize er et værktøj til at normalisere repræsentation af genetiske varianter i VCF'en. Variantnormalisering er formelt defineret som den konsistente repræsentation af genetiske varianter på en utvetydig og præcis måde. I vt er der implementeret en simpel generel algoritme til at fremtvinge dette.

Other Packages Related to vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nyt Perl Compatible Regular Expression Library- 8-bit kørselstidsfiler

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

Download vt

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	756.2 kB	2,565.0 kB	[list of files]
arm64	624.3 kB	2,241.0 kB	[list of files]
armel	604.2 kB	2,152.0 kB	[list of files]
armhf	624.4 kB	1,524.0 kB	[list of files]
i386	763.0 kB	2,776.0 kB	[list of files]
mips64el	576.1 kB	3,225.0 kB	[list of files]
mipsel	580.6 kB	2,977.0 kB	[list of files]
ppc64el	693.5 kB	2,833.0 kB	[list of files]
s390x	638.5 kB	2,533.0 kB	[list of files]