Pakiet: vt (0.57721+ds-3)

[ Pakiet źródłowy: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Inne pakiety związane z vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Pobieranie vt

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	756,2 KiB	2 565,0 KiB	[lista plików]
arm64	624,3 KiB	2 241,0 KiB	[lista plików]
armel	604,2 KiB	2 152,0 KiB	[lista plików]
armhf	624,4 KiB	1 524,0 KiB	[lista plików]
i386	763,0 KiB	2 776,0 KiB	[lista plików]
mips64el	576,1 KiB	3 225,0 KiB	[lista plików]
mipsel	580,6 KiB	2 977,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	693,5 KiB	2 833,0 KiB	[lista plików]
s390x	638,5 KiB	2 533,0 KiB	[lista plików]