Paquet : libhts3 (1.11-4)

[ Paquet source : htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libhts3

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  librairie de compression au format XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libhts3

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	369,6 ko	908,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	337,5 ko	844,0 ko	[liste des fichiers]
armel	320,2 ko	808,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	324,7 ko	600,0 ko	[liste des fichiers]
i386	398,8 ko	988,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	341,4 ko	985,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	354,4 ko	958,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	406,1 ko	1 301,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	338,9 ko	936,0 ko	[liste des fichiers]