[ Paquet source : maffilter ]
Paquet : maffilter (1.3.1+dfsg-2 et autres)
Liens pour maffilter
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source maffilter :
- [maffilter_1.3.1+dfsg-2.dsc]
- [maffilter_1.3.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [maffilter_1.3.1+dfsg-2.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Julien Dutheil (Page QA)
- Pranav Ballaney (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [jydu.github.io]
Paquets similaires :
process genome alignment in the Multiple Alignment Format
MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.
* It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous / masked regions. * It can export data into a single or multiple alignment file in format such as Fasta or Clustal. * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the corresponding alignment. * It can perform sliding windows calculations. * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment. * It can compute population genetics statistics, such as site frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.
Autres paquets associés à maffilter
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- bibliothèque Boost.Iostreams
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- dep: libbpp-core4 (>= 2.4.1)
- bibliothèque principale de Bio++
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- dep: libbpp-phyl-omics3 (>= 2.4.1)
- bibliothèque de phylogénétique de Bio++ – composants génomiques
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- dep: libbpp-phyl12 (>= 2.4.1)
- bibliothèque de phylogénétique de Bio++
-
- dep: libbpp-seq-omics3 (>= 2.4.1)
- bibliothèque de séquences pour Bio++ – composants génomiques
-
- dep: libbpp-seq12 (>= 2.4.1)
- bibliothèque de séquences pour Bio++
-
- dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, mipsel, s390x]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]
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- sug: maffilter-examples
- process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
Télécharger maffilter
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 255,5 ko | 1 321,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 235,9 ko | 1 281,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 218,3 ko | 1 148,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 223,5 ko | 1 020,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 262,6 ko | 1 300,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 220,0 ko | 1 456,0 ko | [liste des fichiers] |
mipsel | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 222,4 ko | 1 385,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 254,2 ko | 1 433,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 1.3.1+dfsg-2+b1 | 234,7 ko | 1 333,0 ko | [liste des fichiers] |