Paquet : abyss (2.1.5-7)

[ Paquet source : abyss  ]

assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes

ABySS est un assembleur de séquences de novo parallèles conçu pour les lectures courtes. Il peut servir à assembler des données de séquences de génome ou de transcriptome. La parallélisation est permise par MPI, OpenMP et pthread.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à abyss

• dep: bsdmainutils

  collection d'utilitaires supplémentaires de FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: make

  utilitaire pour mener la compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

Télécharger abyss

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 885,5 ko	8 774,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2 716,8 ko	8 114,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2 724,5 ko	6 470,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2 960,8 ko	9 334,0 ko	[liste des fichiers]