Paketti: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2)

[ Source: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Muut pakettiin sprai liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [ei arm64, ppc64el]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: time

  GNU time ohjelma suorittimen resurssien käytön seurantaan

• sug: make

  utility for directing compilation

• sug: pbalign

  Paketti ei saatavilla

• sug: pbgenomicconsensus

  Paketti ei saatavilla

• sug: pbh5tools

  Paketti ei saatavilla

Imuroi sprai

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,475.9 kt	1,706.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,473.9 kt	1,694.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1,473.3 kt	1,686.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1,471.6 kt	1,666.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1,477.0 kt	1,710.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1,476.7 kt	1,705.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1,475.9 kt	1,690.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1,477.6 kt	1,882.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1,473.9 kt	1,698.0 kt	[tiedostoluettelo]