Paketti: daligner (1.0+git20200727.ed40ce5-3)

[ Source: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Tagit: Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Muut pakettiin daligner liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Imuroi daligner

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	200.3 kt	1,508.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	173.8 kt	1,408.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	168.3 kt	1,436.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	170.4 kt	1,024.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	192.0 kt	1,696.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	167.0 kt	1,575.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	174.3 kt	1,632.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	198.3 kt	2,188.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	188.9 kt	1,572.0 kt	[tiedostoluettelo]