Paket: lagan (2.0-3)

[ Quellcode: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere Pakete mit Bezug zu lagan

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	178,4 kB	827,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	173,7 kB	747,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	161,7 kB	568,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	187,8 kB	828,0 kB	[Liste der Dateien]