Paket: topp (2.6.0+cleaned1-4 und andere)

[ Quellcode: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

Markierungen: GUI-Baukasten: Qt

Andere Pakete mit Bezug zu topp

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [m68k, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [alpha, ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b5) [nicht alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [ia64, m68k]

  Qt-5-Basismodul

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [nicht amd64, i386, ia64, m68k, x32]

  Qt-5-Basismodul

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt-5-GUI-Modul

  oder libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [nicht ia64, m68k, x32]

  Qt-5-GUI-Modul

  oder libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt-5-Widgetmodul

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [nicht ia64, m68k, x32]

  Qt-5-Widgetmodul

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht ia64, m68k, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: libxerces-c3.2 [ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [nicht ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [nicht m68k]

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4	3.028,3 kB	22.688,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.139,1 kB	17.386,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2.769,6 kB	20.673,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.022,0 kB	16.627,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.300,4 kB	16.751,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4	3.752,2 kB	29.894,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3.171,2 kB	17.072,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	2.824,4 kB	23.041,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.075,4 kB	24.774,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.086,3 kB	23.619,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2.961,4 kB	13.352,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.148,7 kB	17.833,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3.266,6 kB	184.756,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.6.0+cleaned1-4	3.027,2 kB	15.324,0 kB	[Liste der Dateien]