Пакет: topp (2.6.0+cleaned1-4 и други)

[ Източник: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

Етикети: Interface Toolkit: Qt

Други пакети, свързани с topp

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [m68k, x32]

  виртуален пакет, предлаган от libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [alpha, ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b5) [не alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [ia64, m68k]

  Qt 5 core module

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [не amd64, i386, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 core module

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI module

  или libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [не ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI module

  или libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [не ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не ia64, m68k, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libxerces-c3.2 [ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [не ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [не m68k]

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

Изтегляне на topp

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4	3 028,3 кБ	22 688,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 139,1 кБ	17 386,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 769,6 кБ	20 673,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 022,0 кБ	16 627,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 300,4 кБ	16 751,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4	3 752,2 кБ	29 894,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3 171,2 кБ	17 072,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 824,4 кБ	23 041,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 075,4 кБ	24 774,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 086,3 кБ	23 619,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 961,4 кБ	13 352,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 148,7 кБ	17 833,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 266,6 кБ	184 756,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.6.0+cleaned1-4	3 027,2 кБ	15 324,0 кБ	[списък на файловете]