Pakiet: topp (2.6.0+cleaned1-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: Qt

Inne pakiety związane z topp

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [m68k, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, m68k, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b1) [alpha]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b5) [nie alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [ia64, m68k]

  Qt 5 core module

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [nie amd64, i386, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 core module

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI module

  lub libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [nie ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI module

  lub libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [nie ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, m68k, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libxerces-c3.2 [ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [nie ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [nie m68k]

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

Pobieranie topp

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4+b1	3 025,6 KiB	22 689,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 139,1 KiB	17 386,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 769,6 KiB	20 673,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 022,0 KiB	16 627,0 KiB	[lista plików]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 300,4 KiB	16 751,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4	3 752,2 KiB	29 894,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 854,9 KiB	20 353,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3 171,2 KiB	17 072,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 824,4 KiB	23 041,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 075,4 KiB	24 774,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 086,3 KiB	23 619,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2 961,4 KiB	13 352,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 148,7 KiB	17 833,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3 266,6 KiB	184 756,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.6.0+cleaned1-4	3 027,2 KiB	15 324,0 KiB	[lista plików]