パッケージ: topp (2.6.0+cleaned1-4 など)

[ ソース: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

タグ: インタフェースツールキット: Qt

その他の topp 関連パッケージ

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [m68k, x32]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, m68k, x32 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [alpha, ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b5) [alpha, ia64, m68k, x32 以外]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [ia64, m68k]

  Qt 5 コアモジュール

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [amd64, i386, ia64, m68k, x32 以外]

  Qt 5 コアモジュール

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32 以外]

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32]

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [ia64, m68k, x32 以外]

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k, x32 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: libxerces-c3.2 [ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [ia64, m68k, x32 以外]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [m68k 以外]

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

topp のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,028.3 kB	22,688.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,139.1 kB	17,386.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2,769.6 kB	20,673.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,022.0 kB	16,627.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,300.4 kB	16,751.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,752.2 kB	29,894.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3,171.2 kB	17,072.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	2,824.4 kB	23,041.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,075.4 kB	24,774.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,086.3 kB	23,619.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b5	2,961.4 kB	13,352.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,148.7 kB	17,833.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4+b5	3,266.6 kB	184,756.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,027.2 kB	15,324.0 kB	[ファイル一覧]