Пакунок: topp (2.6.0+cleaned1-4 and others)

[ Source: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

Tags: Interface Toolkit: Qt

Інші пакунки пов'язані з topp

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [alpha, m68k, x32]

  virtual package provided by libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b5) [alpha]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b3) [hppa]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b4) [not alpha, hppa, ia64, m68k, x32]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [alpha, ia64, m68k]

  Qt 5 — стрижневий модуль

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [not alpha, amd64, i386, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 — стрижневий модуль

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [alpha, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 — модуль ГІК

  or libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [not alpha, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 — модуль ГІК

  or libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [alpha, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [not alpha, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 widgets module

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not alpha, ia64, m68k, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libxerces-c3.2 [alpha, ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [not alpha, ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [alpha, m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [not alpha, m68k]

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

Завантажити topp

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-3+b5	2,978.8 kB	22,869.0 kB	[список файлів]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,139.0 kB	17,386.0 kB	[список файлів]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b4	2,769.8 kB	20,673.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-4+b3	3,020.5 kB	16,615.0 kB	[список файлів]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,298.9 kB	16,751.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-4	3,752.2 kB	29,894.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3,171.2 kB	17,072.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b4	2,823.9 kB	23,041.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,076.1 kB	24,774.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,084.3 kB	23,619.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b4	2,965.2 kB	13,352.0 kB	[список файлів]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,150.9 kB	17,833.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-4+b4	3,265.2 kB	184,756.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2.6.0+cleaned1-4	3,027.2 kB	15,324.0 kB	[список файлів]