Paket: snpomatic (1.0-7 und andere)

[ Quellcode: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, riscv64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

snpomatic herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.0-7	83,6 kB	208,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0-7+b1	72,4 kB	217,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0-7	66,4 kB	167,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0-7	67,5 kB	127,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0-7	85,9 kB	211,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0-7	74,8 kB	222,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0-7	82,2 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0-7	77,9 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0-7	79,3 kB	204,0 kB	[Liste der Dateien]