Paket: garli-mpi (2.1-7)

[ Quellcode: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Andere Pakete mit Bezug zu garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [nicht amd64]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: openmpi-bin

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Programmdateien

garli-mpi herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	601,8 kB	1.640,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	551,6 kB	1.432,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	493,7 kB	1.319,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	472,4 kB	919,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	534,4 kB	1.535,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	590,4 kB	1.833,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	587,2 kB	1.743,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	669,9 kB	1.812,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	492,4 kB	1.572,0 kB	[Liste der Dateien]