Paket: bcftools (1.21-1)

[ Quellcode: bcftools  ]

Aufruf und Manipulation genomischer Varianten von VCF/BCF-Dateien

BCFtools ist eine Reihe von Dienstprogrammen, die Variantenaufrufe im Variant Call Format (VCF) und dessen binärem Gegenstück BCF bearbeiten. Alle Befehle arbeiten transparent mit VCFs und BCFs, sowohl unkomprimiert als auch BGZF-komprimiert.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• rec: python3-gffutils

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	765,3 kB	2.716,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	689,7 kB	4.156,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	671,3 kB	4.044,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	673,1 kB	3.724,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	809,6 kB	2.812,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	702,5 kB	4.357,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	799,1 kB	4.596,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	753,1 kB	2.210,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	785,2 kB	2.765,0 kB	[Liste der Dateien]