Package: sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Source: sibelia  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Komparativ genomisk værktøj

Sibelia (Synteny Block ExpLoration-værktøj) er et komparativt genomværktøj: Det assisterer biologer med at analysere genomvariationerne, der korrelerer med bakterier, eller de genomændringer, der hjælper mikroorganismer med at tilpasse sig i forskellige miljøer. Sibelia vil også være nyttig til evolutionær studier og genomflytningsstudier for flere stammer af mikroorganismer.

Siblia er nyttig til at finde:

 1) delte regioner
 2) regioner der er repræsenteret i en gruppe af genomer men ikke
    i andre
 3) flytninger der transformerer et genom til andre genomer

Other Packages Related to sibelia

• dep: lagan

  Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser

• dep: libc6 (>= 2.34) [not sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  Hurtig suffiks-tabelkonstruktion

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not m68k]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• sug: sibelia-examples

  Komparativ genomisk værktøj - dataeksempler

Download sibelia

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	329.2 kB	1,232.0 kB	[list of files]
arm64	292.5 kB	1,228.0 kB	[list of files]
armel	293.8 kB	1,171.0 kB	[list of files]
armhf	299.1 kB	967.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	296.3 kB	1,059.0 kB	[list of files]
i386	342.2 kB	1,223.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	317.8 kB	1,347.0 kB	[list of files]
mips64el	288.0 kB	1,255.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	311.4 kB	1,292.0 kB	[list of files]
ppc64el	315.0 kB	1,228.0 kB	[list of files]
riscv64	308.1 kB	1,056.0 kB	[list of files]
s390x	316.6 kB	1,148.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	358.6 kB	1,164.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	280.3 kB	2,128.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	331.3 kB	1,175.0 kB	[list of files]