Paquet : sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Paquet source : sibelia  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Autres paquets associés à sibelia

• dep: lagan

  alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

• dep: libc6 (>= 2.34) [non sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non m68k]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Télécharger sibelia

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	329,2 ko	1 232,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	292,5 ko	1 228,0 ko	[liste des fichiers]
armel	293,8 ko	1 171,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	299,1 ko	967,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	296,3 ko	1 059,0 ko	[liste des fichiers]
i386	342,2 ko	1 223,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	317,8 ko	1 347,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	288,0 ko	1 255,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	311,4 ko	1 292,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	315,0 ko	1 228,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	308,1 ko	1 056,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	316,6 ko	1 148,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	358,6 ko	1 164,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	280,3 ko	2 128,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	331,3 ko	1 175,0 ko	[liste des fichiers]