Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Източник: sibelia  ]

Експериментален пакет

Предупреждение: Този пакет е от дистрибуцията experimental. Това означава, че е възможно да е нестабилен или да има грешки, а може дори и да предизвика загуба на данни. Прочетете информация за промените и останалата документация преди да го използвате.

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Други пакети, свързани с sibelia

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.34) [не sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не m68k]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Изтегляне на sibelia

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	329,2 кБ	1 232,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	292,5 кБ	1 228,0 кБ	[списък на файловете]
armel	293,8 кБ	1 171,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	299,1 кБ	967,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	296,3 кБ	1 059,0 кБ	[списък на файловете]
i386	342,2 кБ	1 223,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	317,8 кБ	1 347,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	288,0 кБ	1 255,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	311,4 кБ	1 292,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	315,0 кБ	1 228,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	308,1 кБ	1 056,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	316,6 кБ	1 148,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	358,6 кБ	1 164,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	280,3 кБ	2 128,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	331,3 кБ	1 175,0 кБ	[списък на файловете]