Package: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

[ Source: sibelia  ]

Komparativ genomisk værktøj

Sibelia (Synteny Block ExpLoration-værktøj) er et komparativt genomværktøj: Det assisterer biologer med at analysere genomvariationerne, der korrelerer med bakterier, eller de genomændringer, der hjælper mikroorganismer med at tilpasse sig i forskellige miljøer. Sibelia vil også være nyttig til evolutionær studier og genomflytningsstudier for flere stammer af mikroorganismer.

Siblia er nyttig til at finde:

 1) delte regioner
 2) regioner der er repræsenteret i en gruppe af genomer men ikke
    i andre
 3) flytninger der transformerer et genom til andre genomer

Other Packages Related to sibelia

• dep: lagan

  Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  Hurtig suffiks-tabelkonstruktion

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  Komparativ genomisk værktøj - dataeksempler

Download sibelia

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	309.7 kB	1,176.0 kB	[list of files]
arm64	278.3 kB	1,120.0 kB	[list of files]
armel	283.4 kB	1,139.0 kB	[list of files]
armhf	289.5 kB	955.0 kB	[list of files]
i386	312.3 kB	1,151.0 kB	[list of files]
mips64el	278.1 kB	1,250.0 kB	[list of files]
mipsel	276.8 kB	1,261.0 kB	[list of files]
ppc64el	305.1 kB	1,228.0 kB	[list of files]
s390x	275.7 kB	1,128.0 kB	[list of files]