Paket: sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Quellcode: sibelia  ]

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Andere Pakete mit Bezug zu sibelia

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht m68k]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

sibelia herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	329,2 kB	1.232,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	292,5 kB	1.228,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	293,8 kB	1.171,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	299,1 kB	967,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	296,3 kB	1.059,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	342,2 kB	1.223,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	317,8 kB	1.347,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	288,0 kB	1.255,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	311,4 kB	1.292,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	315,0 kB	1.228,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	308,1 kB	1.056,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	316,6 kB	1.148,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	358,6 kB	1.164,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	280,3 kB	2.128,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	331,3 kB	1.175,0 kB	[Liste der Dateien]