Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Источник: sibelia  ]

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Другие пакеты, относящиеся к sibelia

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.34) [не sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не m68k]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Загрузка sibelia

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	329,2 Кб	1 232,0 Кб	[список файлов]
arm64	292,5 Кб	1 228,0 Кб	[список файлов]
armel	293,8 Кб	1 171,0 Кб	[список файлов]
armhf	299,1 Кб	967,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	296,3 Кб	1 059,0 Кб	[список файлов]
i386	342,2 Кб	1 223,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	317,8 Кб	1 347,0 Кб	[список файлов]
mips64el	288,0 Кб	1 255,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	311,4 Кб	1 292,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	315,0 Кб	1 228,0 Кб	[список файлов]
riscv64	308,1 Кб	1 056,0 Кб	[список файлов]
s390x	316,6 Кб	1 148,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	358,6 Кб	1 164,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	280,3 Кб	2 128,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	331,3 Кб	1 175,0 Кб	[список файлов]