软件包：tiddit（2.12.0+dfsg-3 以及其他的）

[ 源代码： tiddit  ]

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

其他与 tiddit 有关的软件包

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [除 amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 9) [除 armel, armhf]

• dep: python3

  交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

下载 tiddit

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	2.12.0+dfsg-3+b1	245.1 kB	1,040.0 kB	[文件列表]
arm64	2.12.0+dfsg-3+b1	206.7 kB	835.0 kB	[文件列表]
armel	2.12.0+dfsg-3+b1	207.0 kB	810.0 kB	[文件列表]
armhf	2.12.0+dfsg-3+b1	213.0 kB	578.0 kB	[文件列表]
i386	2.12.0+dfsg-3+b1	239.5 kB	1,019.0 kB	[文件列表]
mips64el	2.12.0+dfsg-3+b1	199.4 kB	928.0 kB	[文件列表]
mipsel	2.12.0+dfsg-3+b1	203.4 kB	888.0 kB	[文件列表]
ppc64el	2.12.0+dfsg-3+b1	228.0 kB	1,168.0 kB	[文件列表]
s390x	2.12.0+dfsg-3+b1	200.7 kB	951.0 kB	[文件列表]