套件：tiddit（2.12.0+dfsg-3 以及其他的）

[ 原始碼： tiddit  ]

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

其他與 tiddit 有關的套件

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [除 amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [除 armel, armhf]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

下載 tiddit

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
amd64	2.12.0+dfsg-3+b1	245。1 kB	1，040。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.12.0+dfsg-3+b1	206。7 kB	835。0 kB	[檔案列表]
armel	2.12.0+dfsg-3+b1	207。0 kB	810。0 kB	[檔案列表]
armhf	2.12.0+dfsg-3+b1	213。0 kB	578。0 kB	[檔案列表]
i386	2.12.0+dfsg-3+b1	239。5 kB	1，019。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.12.0+dfsg-3+b1	199。4 kB	928。0 kB	[檔案列表]
mipsel	2.12.0+dfsg-3+b1	203。4 kB	888。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.12.0+dfsg-3+b1	228。0 kB	1，168。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.12.0+dfsg-3+b1	200。7 kB	951。0 kB	[檔案列表]