всички настройки
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: clonalframe  ]

Пакет: clonalframe (1.2-11 и други)

Връзки за clonalframe

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник clonalframe.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data

ClonalFrame identifies the clonal relationships between the members of a sample, while also estimating the chromosomal position of homologous recombination events that have disrupted the clonal inheritance.

ClonalFrame can be applied to any kind of sequence data, from a single fragment of DNA to whole genomes. It is well suited for the analysis of MLST data, where 7 gene fragments have been sequenced, but becomes progressively more powerful as the sequenced regions increase in length and number up to whole genomes. However, it requires the sequences to be aligned. If you have genomic data that is not aligned, it is recommend to use Mauve which produces alignment of whole bacterial genomes in exactly the format required for analysis with ClonalFrame.

Етикети: Implemented in: C++, Role: Program

Други пакети, свързани с clonalframe

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на clonalframe

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 51,1 кБ152,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.2-11+b3 51,5 кБ143,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.2-11+b3 46,9 кБ151,0 кБ [списък на файловете]
armel 1.2-11+b3 43,9 кБ118,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.2-11+b3 42,1 кБ90,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 54,6 кБ149,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.2-11+b3 54,3 кБ134,0 кБ [списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура) 1.2-11+b1 68,7 кБ264,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 47,7 кБ126,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.2-11+b3 54,9 кБ223,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 56,5 кБ215,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.2-11+b3 56,6 кБ215,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 1.2-11+b2 51,1 кБ111,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.2-11+b3 53,9 кБ147,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 56,5 кБ151,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 45,5 кБ1 050,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.2-11+b2 50,9 кБ130,0 кБ [списък на файловете]