软件包：bowtie（1.3.1-3 以及其他的）

bowtie 的相关链接

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外部的资源：

主页 [bowtie-bio.sourceforge.net]

相似软件包：

超快速、内存高效的短读比对工具

本软件包用于解析最新（2010 年）的 DNA 测序技术产生的数据。这些技术会生成相对较短的 DNA 片段，无法直接解读，因此需要像 Bowtie 这样的工具来为每次测序运行得到的短 DNA 片段分配染色体位置。

Bowtie 以每小时超过 2500 万个 35-bp 读段的速率，将短 DNA 序列（读段）比对到人类基因组。它使用 Burrows-Wheeler 索引对基因组进行索引，以降低内存占用：人类基因组的内存占用通常约为 2.2 GB（双端测序为 2.9 GB）。

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c++, interface::commandline, 角色: 程序, 科学: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

其他与 bowtie 有关的软件包

依赖

推荐

建议

增强

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, hppa, loong64, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 alpha, hppa, riscv64, sh4, sparc64, x32]

GCC 支持库

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
dep: libgcc1 [x32]

软件包暂时不可用

dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

软件包暂时不可用
dep: libstdc++6 [x32]

GNU 标准 C++ 库，第3版

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 arm64, hppa, sh4, x32]

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [hppa, sh4]
dep: python3 [除 hppa, sh4, x32]

交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [除 hppa, sh4, x32]

压缩库 - 运行时

sug: bowtie-examples

Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

下载 bowtie

下载可用于所有硬件架构的
硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	1.3.1-3	1,333.8 kB	8,673.0 kB	[文件列表]
amd64	1.3.1-3	1,588.9 kB	6,845.0 kB	[文件列表]
arm64	1.3.1-3+b2	1,286.3 kB	6,738.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	1.0.0-6	894.0 kB	3,548.0 kB	[文件列表]
loong64 （非官方移植版）	1.3.1-3	1,234.9 kB	6,193.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.3.1-3	1,050.6 kB	8,129.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.3.1-3	1,328.0 kB	8,145.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.3.1-3	1,370.8 kB	7,889.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.3.1-3	1,510.0 kB	5,365.0 kB	[文件列表]
s390x	1.3.1-3	1,530.6 kB	6,969.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	1.0.0-6	860.1 kB	3,077.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.3.1-3	1,149.4 kB	14,721.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	1.0.1-2	878.8 kB	3,264.0 kB	[文件列表]