软件包：bowtie（1.3.1-3 以及其他的）

[ 源代码： bowtie  ]

超快速、内存高效的短读比对工具

本软件包用于解析最新（2010 年）的 DNA 测序技术产生的数据。这些技术会生成相对较短的 DNA 片段，无法直接解读，因此需要像 Bowtie 这样的工具来为每次测序运行得到的短 DNA 片段分配染色体位置。

Bowtie 以每小时超过 2500 万个 35-bp 读段的速率，将短 DNA 序列（读段）比对到人类基因组。它使用 Burrows-Wheeler 索引对基因组进行索引，以降低内存占用：人类基因组的内存占用通常约为 2.2 GB（双端测序为 2.9 GB）。

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c++, interface::commandline, 角色: 程序, 科学: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

其他与 bowtie 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 arm64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 riscv64]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 arm64]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: python3

  交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  压缩库 - 运行时

• sug: bowtie-examples

  Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

下载 bowtie

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	1.3.1-3	1,588.9 kB	6,845.0 kB	[文件列表]
arm64	1.3.1-3+b2	1,286.3 kB	6,738.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.3.1-3	1,050.6 kB	8,129.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.3.1-3	1,370.8 kB	7,889.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.3.1-3	1,510.0 kB	5,365.0 kB	[文件列表]
s390x	1.3.1-3	1,530.6 kB	6,969.0 kB	[文件列表]