[ Source: nanopolish ]
Пакунок: nanopolish (0.14.0-1 and others)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Інші пакунки пов'язані з nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, mips64el]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf]
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Завантажити nanopolish
Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|---|
amd64 | 0.14.0-1+b1 | 2,144.8 kB | 9,343.0 kB | [список файлів] |
arm64 | 0.14.0-1+b1 | 2,073.9 kB | 9,219.0 kB | [список файлів] |
armel | 0.14.0-1+b1 | 2,078.6 kB | 9,253.0 kB | [список файлів] |
armhf | 0.14.0-1+b1 | 2,085.1 kB | 8,861.0 kB | [список файлів] |
i386 | 0.14.0-1+b1 | 2,167.9 kB | 9,413.0 kB | [список файлів] |
mips64el | 0.14.0-1+b1 | 2,105.4 kB | 9,592.0 kB | [список файлів] |
ppc64el | 0.14.0-1+b1 | 2,149.2 kB | 9,603.0 kB | [список файлів] |
riscv64 | 0.14.0-1+b2 | 2,150.1 kB | 9,083.0 kB | [список файлів] |