all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: stringtie  ]

Пакунок: stringtie (2.1.4+ds-4)

Links for stringtie

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package stringtie:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

assemble short RNAseq reads to transcripts

The abundance of transcripts in a human tissue sample can be determined by RNA sequencing. The exact sequence sampled may be random, depending on the technology used. And it may be short, i.e. shorter than the transcript. At some point, many shorter reads need to be assembled to the model the complete transcripts.

StringTie knows how to assemble of RNA-Seq into potential transcripts without the need of a reference genome and provides a quantification also of the splice variants.

Інші пакунки пов'язані з stringtie

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити stringtie

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 397.0 kB1,018.0 kB [список файлів]
arm64 340.6 kB970.0 kB [список файлів]
armel 332.9 kB949.0 kB [список файлів]
armhf 344.0 kB657.0 kB [список файлів]
i386 419.7 kB1,237.0 kB [список файлів]
mips64el 356.1 kB1,194.0 kB [список файлів]
mipsel 350.4 kB1,177.0 kB [список файлів]
ppc64el 402.0 kB1,310.0 kB [список файлів]
s390x 354.9 kB1,078.0 kB [список файлів]