Tarkennettu haku
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: stringtie  ]

Paketti: stringtie (2.1.4+ds-4)

Links for stringtie

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti stringtie:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

assemble short RNAseq reads to transcripts

The abundance of transcripts in a human tissue sample can be determined by RNA sequencing. The exact sequence sampled may be random, depending on the technology used. And it may be short, i.e. shorter than the transcript. At some point, many shorter reads need to be assembled to the model the complete transcripts.

StringTie knows how to assemble of RNA-Seq into potential transcripts without the need of a reference genome and provides a quantification also of the splice variants.

Muut pakettiin stringtie liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Imuroi stringtie

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
amd64 397.0 kt1,018.0 kt [tiedostoluettelo]
arm64 340.6 kt970.0 kt [tiedostoluettelo]
armel 332.9 kt949.0 kt [tiedostoluettelo]
armhf 344.0 kt657.0 kt [tiedostoluettelo]
i386 419.7 kt1,237.0 kt [tiedostoluettelo]
mips64el 356.1 kt1,194.0 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 350.4 kt1,177.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 402.0 kt1,310.0 kt [tiedostoluettelo]
s390x 354.9 kt1,078.0 kt [tiedostoluettelo]