Paket: phybin (0.3-5)

[ Källkod: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Andra paket besläktade med phybin

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libffi7 (>= 3.3~20180313)

  Foreign Function Interface library runtime

• dep: libgmp10

  Multiprecision arithmetic library

Hämta phybin

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.537,4 kbyte	11.602,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.926,3 kbyte	14.579,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.799,7 kbyte	12.190,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.807,4 kbyte	12.158,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.586,5 kbyte	9.347,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	5.155,1 kbyte	56.961,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	3.415,4 kbyte	38.965,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	3.395,8 kbyte	37.296,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	7.441,9 kbyte	52.929,0 kbyte	[filförteckning]