Paketti: lagan (2.0-9)

[ Source: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Muut pakettiin lagan liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi lagan

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	179.3 kt	835.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	170.3 kt	1,771.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	163.8 kt	1,748.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	163.2 kt	1,748.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	187.1 kt	836.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	182.8 kt	1,865.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	185.5 kt	1,844.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	200.1 kt	1,963.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	172.6 kt	795.0 kt	[tiedostoluettelo]