[ Zdroj: libssw ]
Balík: ssw-align (1.1-15 a iné)
Odkazy pre ssw-align
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík libssw:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Sascha Steinbiss (Stránka QA)
- Michael R. Crusoe (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom ssw-align
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libssw0 (= 1.1-14) [ia64]
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
- dep: libssw0 (= 1.1-15) [alpha]
- dep: libssw0 (= 1.1-15+b1) [nie alpha, ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, m68k, sh4]
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]
Stiahnuť ssw-align
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| alpha (neoficiálny port) | 1.1-15 | 25.8 kB | 83.0 kB | [zoznam súborov] |
| amd64 | 1.1-15+b1 | 22.3 kB | 60.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 1.1-15+b1 | 20.2 kB | 84.0 kB | [zoznam súborov] |
| armel | 1.1-15+b1 | 24.1 kB | 63.0 kB | [zoznam súborov] |
| armhf | 1.1-15+b1 | 22.5 kB | 51.0 kB | [zoznam súborov] |
| i386 | 1.1-15+b1 | 26.8 kB | 79.0 kB | [zoznam súborov] |
| ia64 (neoficiálny port) | 1.1-14 | 31.2 kB | 94.0 kB | [zoznam súborov] |
| m68k (neoficiálny port) | 1.1-15+b1 | 22.9 kB | 67.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 1.1-15+b1 | 25.8 kB | 84.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64 (neoficiálny port) | 1.1-15+b1 | 25.9 kB | 84.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 1.1-15+b1 | 23.8 kB | 84.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 1.1-15+b1 | 25.6 kB | 56.0 kB | [zoznam súborov] |
| s390x | 1.1-15+b1 | 27.4 kB | 67.0 kB | [zoznam súborov] |
| sh4 (neoficiálny port) | 1.1-15+b1 | 29.0 kB | 83.0 kB | [zoznam súborov] |
| sparc64 (neoficiálny port) | 1.1-15+b1 | 25.4 kB | 1,044.0 kB | [zoznam súborov] |
| x32 (neoficiálny port) | 1.1-15+b1 | 22.2 kB | 59.0 kB | [zoznam súborov] |