Пакунок: ssw-align (1.1-15 and others)
Links for ssw-align
Debian Resources:
Download Source Package libssw:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Sascha Steinbiss (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
Інші пакунки пов'язані з ssw-align
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libssw0 (= 1.1-14) [ia64]
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
- dep: libssw0 (= 1.1-15) [alpha, sh4]
- dep: libssw0 (= 1.1-15+b1) [not alpha, ia64, sh4]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, m68k, sh4]
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]
Завантажити ssw-align
Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|---|
alpha (unofficial port) | 1.1-15 | 25.8 kB | 83.0 kB | [список файлів] |
amd64 | 1.1-15+b1 | 22.3 kB | 60.0 kB | [список файлів] |
arm64 | 1.1-15+b1 | 20.2 kB | 84.0 kB | [список файлів] |
armel | 1.1-15+b1 | 24.1 kB | 63.0 kB | [список файлів] |
armhf | 1.1-15+b1 | 22.5 kB | 51.0 kB | [список файлів] |
i386 | 1.1-15+b1 | 26.8 kB | 79.0 kB | [список файлів] |
ia64 (unofficial port) | 1.1-14 | 31.2 kB | 94.0 kB | [список файлів] |
m68k (unofficial port) | 1.1-15+b1 | 22.9 kB | 67.0 kB | [список файлів] |
mips64el | 1.1-15+b1 | 25.8 kB | 84.0 kB | [список файлів] |
ppc64 (unofficial port) | 1.1-15+b1 | 25.9 kB | 84.0 kB | [список файлів] |
ppc64el | 1.1-15+b1 | 23.8 kB | 84.0 kB | [список файлів] |
riscv64 | 1.1-15+b1 | 25.6 kB | 56.0 kB | [список файлів] |
s390x | 1.1-15+b1 | 27.4 kB | 67.0 kB | [список файлів] |
sh4 (unofficial port) | 1.1-15 | 28.3 kB | 82.0 kB | [список файлів] |
sparc64 (unofficial port) | 1.1-15+b1 | 25.4 kB | 1,044.0 kB | [список файлів] |
x32 (unofficial port) | 1.1-15+b1 | 22.2 kB | 59.0 kB | [список файлів] |