Pacote: ssw-align (1.1-15 e outros)

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Fontes externas:

Pagina principal [github.com]

Pacotes similares:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Outros pacotes relacionados a ssw-align

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libssw0 (= 1.1-14) [ia64]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

dep: libssw0 (= 1.1-15+b2) [não ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [não armel, armhf, m68k, sh4]

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]

Download de ssw-align

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.1-15+b2	26.2 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.1-15+b2	22.3 kB	60.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.1-15+b2	20.2 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.1-15+b2	24.2 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.1-15+b2	22.6 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.1-15+b2	26.8 kB	79.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.1-14	31.2 kB	94.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.1-15+b2	21.0 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.1-15+b2	22.9 kB	67.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.1-15+b2	26.0 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.1-15+b2	25.9 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.1-15+b2	23.8 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.1-15+b2	25.6 kB	56.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.1-15+b2	27.4 kB	67.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.1-15+b2	29.0 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.1-15+b2	25.5 kB	1,044.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.1-15+b2	22.3 kB	59.0 kB	[lista de arquivos]