パッケージ: ssw-align (1.1-15 など)

[ ソース: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

その他の ssw-align 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libssw0 (= 1.1-14) [ia64]

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

  dep: libssw0 (= 1.1-15+b2) [ia64 以外]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, m68k, sh4 以外]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]

ssw-align のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.1-15+b2	26.2 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.1-15+b2	22.3 kB	60.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1-15+b2	20.2 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.1-15+b2	24.2 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.1-15+b2	22.6 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.1-15+b2	26.8 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.1-14	31.2 kB	94.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.1-15+b2	21.0 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.1-15+b2	22.9 kB	67.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.1-15+b2	26.0 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.1-15+b2	25.9 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.1-15+b2	23.8 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.1-15+b2	25.6 kB	56.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.1-15+b2	27.4 kB	67.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.1-15+b2	29.0 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.1-15+b2	25.5 kB	1,044.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.1-15+b2	22.3 kB	59.0 kB	[ファイル一覧]