Balík: ssw-align (1.1-13)

[ Zdroj: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ssw-align

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libssw0 (= 1.1-13)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť ssw-align

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	20.7 kB	54.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	19.7 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
armel	23.9 kB	66.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	22.0 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
i386	27.7 kB	82.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	27.9 kB	76.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	27.3 kB	71.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	20.5 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	25.3 kB	75.0 kB	[zoznam súborov]