Paket: ssw-align (1.1-15 und andere)

[ Quellcode: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andere Pakete mit Bezug zu ssw-align

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libssw0 (= 1.1-14) [ia64]

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

  dep: libssw0 (= 1.1-15) [alpha, sh4]

  dep: libssw0 (= 1.1-15+b1) [nicht alpha, ia64, sh4]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf, m68k, sh4]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]

ssw-align herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.1-15	25,8 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.1-15+b1	22,3 kB	60,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1-15+b1	20,2 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.1-15+b1	24,1 kB	63,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.1-15+b1	22,5 kB	51,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.1-15+b1	26,8 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.1-14	31,2 kB	94,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.1-15+b1	22,9 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.1-15+b1	25,8 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.1-15+b1	25,9 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.1-15+b1	23,8 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.1-15+b1	25,6 kB	56,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.1-15+b1	27,4 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.1-15	28,3 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.1-15+b1	25,4 kB	1.044,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.1-15+b1	22,2 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]