Balík: libssw0 (1.1-15 a iné)

[ Zdroj: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Značky: Role: Shared Library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf, ia64, m68k]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: zlib1g

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť libssw0

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.1-15	24.1 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.1-15+b2	21.3 kB	64.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.1-15+b2	19.6 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.1-15+b2	20.9 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.1-15+b2	21.2 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.1-15+b2	26.1 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.1-14	28.7 kB	89.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.1-15+b2	23.0 kB	68.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.1-15+b2	25.5 kB	86.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.1-15+b2	25.2 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.1-15+b2	22.3 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.1-15+b2	25.3 kB	60.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.1-15+b2	25.5 kB	68.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.1-15+b2	27.9 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.1-15+b2	23.8 kB	1,046.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.1-15+b2	21.2 kB	60.0 kB	[zoznam súborov]