Pacote: porechop (0.2.4+dfsg-6 e outros)

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Fontes externas:

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Pacotes similares:

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Outros pacotes relacionados a porechop

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

Biblioteca de suporte GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteca de suporte GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteca de suporte GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Biblioteca C++ padrão da GNU v3
dep: libunwind8 [ia64]

biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3~)

Download de porechop

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	54.6 kB	290.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.2.4+dfsg-6	55.9 kB	238.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b1	53.2 kB	227.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.2.4+dfsg-6	51.0 kB	221.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.2.4+dfsg-6	51.2 kB	205.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	55.4 kB	230.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.2.4+dfsg-6	56.9 kB	237.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-5	61.8 kB	290.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	52.9 kB	226.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	53.0 kB	225.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.2.4+dfsg-6	52.9 kB	231.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	57.8 kB	291.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.2.4+dfsg-6	58.2 kB	290.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.2.4+dfsg-6	55.6 kB	218.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.2.4+dfsg-6	57.7 kB	242.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	58.6 kB	225.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	51.3 kB	1,188.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.2.4+dfsg-6	55.4 kB	233.0 kB	[lista de arquivos]