Пакет: porechop (0.2.4+dfsg-8)

[ Источник: porechop  ]

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Другие пакеты, относящиеся к porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, hppa, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Загрузка porechop

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	56,4 Кб	237,0 Кб	[список файлов]
arm64	53,2 Кб	225,0 Кб	[список файлов]
armel	51,1 Кб	217,0 Кб	[список файлов]
armhf	51,3 Кб	205,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	55,6 Кб	226,0 Кб	[список файлов]
i386	57,4 Кб	237,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	53,1 Кб	225,0 Кб	[список файлов]
mips64el	53,9 Кб	292,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	57,6 Кб	290,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	57,8 Кб	289,0 Кб	[список файлов]
riscv64	55,8 Кб	213,0 Кб	[список файлов]
s390x	56,9 Кб	237,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	59,0 Кб	225,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	51,3 Кб	1 187,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	56,3 Кб	233,0 Кб	[список файлов]