Пакет: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 и другие)

[ Источник: pbbam  ]

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Другие пакеты, относящиеся к pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не ia64, m68k, sh4]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10) [m68k, sh4]

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libhts3t64 (>= 1.17) [не m68k, sh4]

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpbbam1.3.0 (= 1.3.0+dfsg-2) [m68k, sh4]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b2) [loong64]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

  dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b3) [ia64]

  dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b4) [не ia64, loong64, m68k, sh4]

• dep: libpbcopper1.3.0 (>= 1.4.0+dfsg) [m68k, sh4]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [не m68k, sh4]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не m68k, sh4]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка pbbamtools

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.4.0+dfsg-1+b4	122,5 Кб	686,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.4.0+dfsg-1+b4	133,8 Кб	479,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.4.0+dfsg-1+b4	116,9 Кб	619,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.4.0+dfsg-1+b3	145,0 Кб	712,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	2.4.0+dfsg-1+b2	119,7 Кб	459,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.3.0+dfsg-2	79,1 Кб	274,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.4.0+dfsg-1+b4	120,7 Кб	702,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.4.0+dfsg-1+b4	127,2 Кб	683,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.4.0+dfsg-1+b4	123,5 Кб	363,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.3.0+dfsg-2	88,0 Кб	256,0 Кб	[список файлов]