Pakiet: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 i inne)
Odnośniki dla pbbamtools
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego pbbam:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [pbbam.readthedocs.org]
Podobne pakiety:
processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.
PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.
This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.
Inne pakiety związane z pbbamtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, m68k, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie ia64, m68k, sh4]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [m68k, sh4]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nie m68k, sh4]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libpbbam1.3.0 (= 1.3.0+dfsg-2) [m68k, sh4]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
-
- dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b3) [nie m68k, sh4]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
-
- dep: libpbcopper1.3.0 (>= 1.4.0+dfsg) [m68k, sh4]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
-
- dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [nie m68k, sh4]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie m68k, sh4]
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
-
- rec: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
Pobieranie pbbamtools
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 120,9 KiB | 686,0 KiB | [lista plików] |
amd64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 129,6 KiB | 475,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 115,8 KiB | 619,0 KiB | [lista plików] |
ia64 (port nieoficjalny) | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 145,0 KiB | 712,0 KiB | [lista plików] |
m68k (port nieoficjalny) | 1.3.0+dfsg-2 | 79,1 KiB | 274,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 120,5 KiB | 703,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 126,8 KiB | 683,0 KiB | [lista plików] |
riscv64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 122,4 KiB | 363,0 KiB | [lista plików] |
sh4 (port nieoficjalny) | 1.3.0+dfsg-2 | 88,0 KiB | 256,0 KiB | [lista plików] |