Pacote: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 e outros)

[ Fonte: pbbam  ]

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Outros pacotes relacionados a pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
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  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

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  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

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  Biblioteca de suporte GCC

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  C library for high-throughput sequencing data formats

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• dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b2) [loong64]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

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  dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b4) [não ia64, loong64, m68k, sh4]

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  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [não m68k, sh4]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não m68k, sh4]

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  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de pbbamtools

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.4.0+dfsg-1+b4	122.5 kB	686.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	2.4.0+dfsg-1+b4	133.8 kB	479.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.4.0+dfsg-1+b4	116.9 kB	619.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	2.4.0+dfsg-1+b3	145.0 kB	712.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	2.4.0+dfsg-1+b2	119.7 kB	459.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.3.0+dfsg-2	79.1 kB	274.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.4.0+dfsg-1+b4	120.7 kB	702.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.4.0+dfsg-1+b4	127.2 kB	683.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.4.0+dfsg-1+b4	123.5 kB	363.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.3.0+dfsg-2	88.0 kB	256.0 kB	[lista de arquivos]