Пакет: openbabel (3.1.1+dfsg-11 и другие)

[ Источник: openbabel  ]

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

Теги: Область: Химия, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Область: Утилита, Цель: Преобразование данных

Другие пакеты, относящиеся к openbabel

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libopenbabel7 (>= 3.1.1+dfsg)

  Chemical toolbox library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка openbabel

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-11+b1	126,2 Кб	1 453,0 Кб	[список файлов]
amd64	3.1.1+dfsg-11+b3	125,8 Кб	628,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.1.1+dfsg-11+b2	117,4 Кб	1 389,0 Кб	[список файлов]
armel	3.1.1+dfsg-11+b2	119,8 Кб	1 370,0 Кб	[список файлов]
armhf	3.1.1+dfsg-11+b2	120,2 Кб	1 370,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-11+b2	129,2 Кб	561,0 Кб	[список файлов]
i386	3.1.1+dfsg-11+b3	128,2 Кб	613,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-9	136,3 Кб	731,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-9+b1	131,6 Кб	573,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.1.1+dfsg-11+b2	126,5 Кб	1 408,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-11+b2	123,5 Кб	1 471,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.1.1+dfsg-11+b2	124,4 Кб	1 453,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.1.1+dfsg-11+b2	123,0 Кб	513,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.1.1+dfsg-11+b2	123,4 Кб	560,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-11+b1	141,9 Кб	1 369,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-11+b2	120,6 Кб	19 659,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	3.1.1+dfsg-9+b1	122,7 Кб	590,0 Кб	[список файлов]