Paquet : openbabel (3.1.1+dfsg-11 et autres)
Liens pour openbabel
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source openbabel :
- [openbabel_3.1.1+dfsg-11.dsc]
- [openbabel_3.1.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [openbabel_3.1.1+dfsg-11.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debichem Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Michael Banck (Page QA)
- Daniel Leidert (Page QA)
- Andrius Merkys (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [openbabel.org]
Paquets similaires :
boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande
Open Babel est une boite à outils dans le domaine de la chimie. Elle a été conçue pour prendre en charge les nombreux langages des données chimiques. Elle permet de rechercher, convertir, analyser ou bien stocker les données de modélisation moléculaire, de chimie, de matériaux solides, de biochimie ou de domaines connexes. Les fonctionnalités comprennent :
− ajout ou suppression d'hydrogène ; − gestion de la dynamique moléculaire ; − gestion de la syntaxe de reconnaissance moléculaire SMARTS ; − perception automatique des propriétés (cycles, liaisons, hybridation ou aromaticité) ; − typage flexible des atomes et perception des liaisons multiples d'après les coordonnées atomiques ; − calcul de charge partielle de Gasteiger-Marsili.
Les formats de fichiers traités par Open Babel comprennent : PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL, Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC et MPQC.
Ce paquet comprend les utilitaires suivants :
– obabel : conversion entre divers formats de fichiers de chimie ; – obenergy : calcul de l'énergie d'une molécule ; – obminimize : optimisation de la géométrie, minimisation de l'énergie d'une molécule ; – obgrep : programme de recherche moléculaire utilisant le modèle SMARTS ; – obgen : génération des coordonnées en 3D d'une molécule ; – obprop : affichage des propriétés standard d'une molécule ; – obfit : superposition de deux molécules à partir d'un modèle ; – obrotamer : génération de coordonnées de conformères ou rotamères ; – obconformer : génération de conformères de faible énergie ; – obchiral : affichage des informations de chiralité moléculaire ; – obrotate : notation d’angle dièdre de molécules en mode automatique (batch) ; – obprobe : création d’une grille de sonde électrostatique.
Autres paquets associés à openbabel
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- dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, x32]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, m68k, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libopenbabel7 (>= 3.1.1+dfsg)
- Chemical toolbox library
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non ia64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
Télécharger openbabel
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|---|
alpha (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-11 | 125,6 ko | 1 452,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 125,6 ko | 628,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 117,3 ko | 1 389,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 118,7 ko | 502,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 119,0 ko | 466,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 129,1 ko | 561,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 128,1 ko | 613,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-9 | 136,3 ko | 731,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-9+b1 | 131,6 ko | 573,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 122,1 ko | 1 408,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 123,3 ko | 1 471,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 124,3 ko | 1 453,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 122,7 ko | 509,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 123,2 ko | 556,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-11 | 141,5 ko | 1 368,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-11+b1 | 120,5 ko | 19 659,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 3.1.1+dfsg-9+b1 | 122,7 ko | 590,0 ko | [liste des fichiers] |