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Paket: openbabel (3.1.1+dfsg-11 und andere)

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Ähnliche Pakete:

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

Markierungen: Feld: Chemie, Implementiert in: C++, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Daten-Konvertierung

Andere Pakete mit Bezug zu openbabel

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Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-11 125,6 kB1.452,0 kB [Liste der Dateien]
amd64 3.1.1+dfsg-11+b1 125,6 kB628,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 3.1.1+dfsg-11+b1 117,3 kB1.389,0 kB [Liste der Dateien]
armel 3.1.1+dfsg-11+b1 118,7 kB502,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 3.1.1+dfsg-11+b1 119,0 kB466,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-11+b1 129,1 kB561,0 kB [Liste der Dateien]
i386 3.1.1+dfsg-11+b1 128,1 kB613,0 kB [Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-9 136,3 kB731,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-9+b1 131,6 kB573,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 3.1.1+dfsg-11+b1 122,1 kB1.408,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-11+b1 123,3 kB1.471,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 3.1.1+dfsg-11+b1 124,3 kB1.453,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 3.1.1+dfsg-11+b1 122,7 kB509,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 3.1.1+dfsg-11+b1 123,2 kB556,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-11 141,5 kB1.368,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-11+b1 120,5 kB19.659,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 3.1.1+dfsg-9+b1 122,7 kB590,0 kB [Liste der Dateien]