Paketti: openbabel (3.1.1+dfsg-12 ja muut)

[ Source: openbabel  ]

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

Tagit: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Muut pakettiin openbabel liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libopenbabel7 (>= 3.1.1+dfsg)

  Chemical toolbox library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi openbabel

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	127.0 kt	1,452.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	3.1.1+dfsg-12	126.5 kt	635.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3.1.1+dfsg-12	118.3 kt	1,388.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	3.1.1+dfsg-12	120.3 kt	1,369.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	3.1.1+dfsg-12	120.5 kt	1,369.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	129.5 kt	560.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3.1.1+dfsg-12	129.1 kt	612.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-9	136.3 kt	731.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	121.9 kt	1,387.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-9+b1	131.6 kt	573.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	3.1.1+dfsg-12	127.6 kt	1,407.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	123.8 kt	1,470.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3.1.1+dfsg-12	124.6 kt	1,452.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	3.1.1+dfsg-12	123.1 kt	516.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	3.1.1+dfsg-12	124.2 kt	563.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	142.9 kt	1,368.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	121.2 kt	19,658.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	3.1.1+dfsg-12	124.4 kt	593.0 kt	[tiedostoluettelo]