все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: openbabel  ]

Пакет: openbabel (3.1.1+dfsg-9 и другие)

Ссылки для openbabel

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код openbabel:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Chemical toolbox utilities (cli)

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows one to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include:

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities:

 * obabel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obgen: Generate 3D coordinates for a molecule
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obconformer: Generate low-energy conformers
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode
 * obprobe: Create electrostatic probe grid

Теги: Область: Химия, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Область: Утилита, Цель: Преобразование данных

Другие пакеты, относящиеся к openbabel

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка openbabel

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 3.1.1+dfsg-9+b3 122,0 Кб608,0 Кб [список файлов]
arm64 3.1.1+dfsg-9+b3 115,3 Кб1 389,0 Кб [список файлов]
armel 3.1.1+dfsg-9+b3 117,5 Кб1 370,0 Кб [список файлов]
armhf 3.1.1+dfsg-9+b3 117,7 Кб1 370,0 Кб [список файлов]
i386 3.1.1+dfsg-9+b3 125,6 Кб609,0 Кб [список файлов]
mips64el 3.1.1+dfsg-9+b3 121,4 Кб1 408,0 Кб [список файлов]
mipsel 3.1.1+dfsg-9+b3 121,2 Кб1 389,0 Кб [список файлов]
ppc64el 3.1.1+dfsg-9+b3 122,2 Кб1 389,0 Кб [список файлов]
s390x 3.1.1+dfsg-9+b3 115,4 Кб556,0 Кб [список файлов]